（1）办公室：负责机关的文电、信息、文字综合、档案管理工作；负责预决算、机关财务、资产管理、内部审计等工作；负责机关日常运转，承担安全、保密、信访、政务公开、新闻宣传和国际合作交流等工作。

（2）待遇保障处：拟定全市职工基本医疗保险、生育保险、市直公务员医疗补助、大额医疗费用补充保险的筹资和待遇政策；统筹城乡居民医疗保障筹资和待遇标准，完善大病保险制度；建立健全医疗保障关系转移接续制度；拟订并组织实施全市医疗救助政策；统筹推进多层次医疗保障体系建设；组织拟订长期护理保险制度改革方案并组织实施；承担医疗保障指标相关工作。

（3）医药服务管理和信息处：拟订医保目录和支付标准，建立动态调整机制，承担医保目录准入相关工作。拟订定点医药机构医保协议和支付管理、异地就医管理办法和结算政策。组织推进医保支付方式改革。组织开展药品、医用耗材、医疗技术的经济性评价。负责局机关信息化建设工作。协调推进医保、医疗、医药“三医联动”改革。

（4）医药价格和招标采购处：拟订药品、医用耗材价格和医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策并组织实施，建立价格信息监测和信息发布制度；拟订药品、医用耗材的招标采购、配送及结算管理政策并监督实施，推进药品供应保障制度建设。

（5）基金监管处：拟订医疗保障基金监督管理办法并组织实施；建立健全医疗保障基金安全防控机制；监督管理纳入医保支付范围的医疗服务行为和医疗费用，规范医保经办业务、依法查处医疗保障领域违法违规行为；负责定点医疗机构、定点药店的监督管理工作；建立健全医疗保障基金监管信息统计、信用评价体系和信息披露制度。负责医保基金的安全防控和内部审计工作。

（6）机关党委办公室（人事处）：负责机关和直属单位的党群、人事管理、机构编制、教育培训、队伍建设工作。负责机关工会工作。机关党委办公室与人事处合署办公。

（7）规划财务与法规处（营商环境建设处）：组织拟订医疗保障工作规划，开展医疗保障形势分析和中长期重大问题研究，承担医疗保障统计工作，负责医保基金预决算草案编制工作，承担基金运行管理相关工作。组织起草医保相关地方性法规和市政府规章草案；承担规范性文件合法性审核工作；负责行政处罚案件的审查和组织听证工作，承担规范行政裁量权和行政执法监督工作；组织医疗保障普法工作，提供法律咨询服务工作；负责本部门营商环境建设工作。